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反渗透膜是整套反渗透设备中非常重要的易耗材料，如果反渗透膜结垢会导致生产成本增高，影响生产。预防反渗透膜结垢应做到：
1、做好原水的预处理工作，特别应注意污染指数的合格，同时还应进行杀菌，防止微生物在器内滋生，注意氯离子对膜的伤害。
2、在反渗透设备运行中，要维持合适的操作压力，一般情况下，增加压力会使产水量增大，但过大又会使反渗透膜压实。
3、应保持盐水侧的紊流状态，减轻反渗透膜表面溶液的浓差极化，避免某些难溶盐在膜表面析出。
4、在反渗透设备停运时，短期应进行加药冲洗，长期应加甲醛保护。
5、当反渗透设备产水量明显减少，表明膜结垢或污染，应进行化学清洗。
6、定期作好原水水质分析，根据水质情况，依据技术支持部提供的加药方案调节阻垢剂的加药量。
7、严防加药设备的跑、冒、滴、漏，将药液加到反渗透进水里，真正起到防止结垢的目的。
8、反渗透设备停运后的冲洗方式改为用除盐水进行冲洗。